昨日,華大集團旗下子公司——華大智造發(fā)布了其自主研發(fā)的最新超高通量基因測序儀——“MGISEQ-T7”。這臺擁有超高通量的基因測序儀一天就可以完成60例個人全基因組測序,日產(chǎn)出數(shù)據(jù)高達6Tb,是目前全球日生產(chǎn)能力最強的基因測序儀,堪稱“超級生命計算機”。
這是華大繼3年前實現(xiàn)測序儀國產(chǎn)化的又一次突破,使其成為全球唯一一個有能力構(gòu)建一條從硬件制造到基因測序服務(wù),再到大數(shù)據(jù)研究的完整基因測序產(chǎn)業(yè)鏈的機構(gòu)。該款設(shè)備的發(fā)布也進一步降低了基因組測序的成本,讓“基因組測序100美元”時代加快來臨。
6臺機器1年可完成十萬人基因組測序
在人體的基因中,有30億個堿基對,要想測出它的全部序列,高通量、快速的測序儀是關(guān)鍵。從國家戰(zhàn)略的層面,高通量基因測序儀的重要性不言而喻。而從基因測序整個產(chǎn)業(yè)來看的話,測序儀是產(chǎn)業(yè)鏈最為重要的一環(huán)。
在行業(yè)上游基本處于國外寡頭壟斷的狀態(tài)下,深圳企業(yè)憑借自主創(chuàng)新“爭上游”,頻頻傳來好消息。
昨天,在深圳舉行的第十三屆國際基因組學(xué)大會上,華大智造發(fā)布了其自主研發(fā)的最新超高通量基因測序儀——“MGISEQ-T7”,大大提高基因測序效率。
華大集團執(zhí)行副總裁、華大智造首席執(zhí)行官牟峰表示,由于受到設(shè)備數(shù)量、速度和成本等原因的制約,全球基因組的測序效率在前幾年推進并不順利。以英國為例,2012年12月,英國啟動十萬人基因組計劃,花了5年半的時間才完成7萬多例全基因組測序。
“超快速、超高通量的T7,堪稱超級生命計算機。”牟峰介紹,一臺T7日產(chǎn)出數(shù)據(jù)高達6Tb,是目前全球日生產(chǎn)能力最強的基因測序儀,一天就可以完成60例個人全基因組測序。以前,十萬人級別的基因組測序可能需要4-6年的時間才能完成。現(xiàn)在,僅需6臺T7,一年時間即可完成。
全球首創(chuàng)4聯(lián)芯片“以一敵四”
這臺基因測序儀如何做到又快又強的?牟峰介紹說,目前,市場上所有的測序儀最多只能支持兩張芯片同時運行,而T7的4聯(lián)芯片平臺采用獨特的芯片搭載技術(shù),可實現(xiàn)4張芯片進行完全獨立的測序流程,如同4臺測序儀同時進行工作,且芯片間互不影響。
測序儀運行速度的快慢將直接影響到測序項目的交付時間,因此,業(yè)界始終致力于提升測序儀的運行速度。華大智造通過全面升級生化系統(tǒng)、光學(xué)系統(tǒng),并將圖像數(shù)據(jù)處理速度提升15倍,從而使得T7測序速度提升到行業(yè)最高水平的50%以上,遠遠領(lǐng)先于其他測序儀。
牟峰告訴記者,測序儀芯片密度越高,意味著可產(chǎn)出更多的有效數(shù)據(jù)量。T7將原有的芯片密度提高了20%,使得單張芯片即可實現(xiàn)Tb級數(shù)據(jù)產(chǎn)出。加之4張芯片可同時獨立運行,24小時無休輪轉(zhuǎn),T7每天最多可產(chǎn)出6Tb數(shù)據(jù),真正實現(xiàn)強大日生產(chǎn)能力。
加快實現(xiàn)“100美元全基因組測序”
“我們通量是全世界最高的近兩倍,我們的價格也是做到非常低的水平,最接近‘100美金完成一個人全基因組測序’的目標。”華大智造執(zhí)行副總裁劉健告訴記者,這必將對目前測序產(chǎn)業(yè)的發(fā)展起到強有力的推動作用,也標志著基于基因檢測的精準醫(yī)學(xué)研究全面進入大數(shù)據(jù)時代成為可能。
據(jù)介紹,基因測序技術(shù)促進精準醫(yī)療,讓罕見病的檢測變得容易、便宜,找出基因變異與疾病之間的關(guān)聯(lián)。這項技術(shù)雖好,但成本不低,特別是基因測序的價格在早期曾讓人可望而不可及——10年前測量一個人的全基因組數(shù)據(jù)需要30萬美元,如今已降至1000美元左右。
為了讓基因測序的產(chǎn)品從“陽春白雪”走向平常百姓家,業(yè)內(nèi)一直以“100美元全基因組測序”為目標,到那時,以基因測序為基礎(chǔ)的精準醫(yī)療產(chǎn)業(yè)才能真正駛上快車道。
劉健向記者透露:“今天做一個全基因組測序,目前價格最低還是華大的600美元,其他的很多還是800或1000美元,雖然不能說具體的數(shù)字,但是在一定量的情況下,華大能率先進入從1000美元到100美元沖刺的后半段的。”